元熙二年，劉裕完成了逆襲，自從桓玄篡位以來一路高升的他以自己的能力為東晉續(xù)命16年，在完全消滅東晉其他軍頭之后，迫使晉恭帝禪位，自己建立劉宋政權(quán)，延續(xù)百年的東晉正式滅亡。

東晉最后一任皇帝是司馬德文，他禪位之后，被降奉為零陵王，遷居到秣陵。劉裕已經(jīng)65歲，英雄遲暮，當(dāng)時(shí)他的兒子們都太小，雖然劉裕完全掌權(quán)，但是還是很不放心，擔(dān)心自己死了，煮熟的鴨子都飛了。

而且，還害怕前車之鑒再次發(fā)生，16年輕，盤踞荊州的桓玄和他一樣如出一轍，篡位建立楚國，但是當(dāng)時(shí)僅僅把晉安帝遷居到潯陽，這一年是404年，隨后次年，劉裕就以晉朝忠臣的身份攻打桓玄。

不管是因?yàn)榛感幹檬М?dāng)還是當(dāng)時(shí)晉安帝還有號召力，劉裕很快摧毀桓玄的勢力，桓玄被殺，而后劉裕迎晉安帝復(fù)位，也藉此完成鯉魚躍龍門的飛躍，從一個(gè)低階將軍變?yōu)闀x朝權(quán)臣。

正因?yàn)檫@個(gè)事情，劉裕很怕在出現(xiàn)一個(gè)不安分的人打著晉朝天子的旗號來反對他，畢竟當(dāng)時(shí)晉朝一百多年的國祚還是很有號召力的，所有，出身寒門的他抱著一不做二不休的態(tài)度，指使心腹對晉朝最后一任皇帝下手。

司馬德文皇后的兄長褚秀之、褚淡之，當(dāng)劉裕的走狗，一直在暗中監(jiān)視司馬德文，劉裕篡位第二年，褚皇后生下一個(gè)兒子，這讓劉裕感覺很恐慌，于是之間讓褚秀之兩人把他外甥害死。

生怕東山再起的劉裕一直想找機(jī)會(huì)暗害司馬德文，但是不能明著來，這就是所謂既想當(dāng)婊子，又想立牌坊，曾經(jīng)派人去暗殺他，但是派去的人半路自殺，司馬德文也感覺到了危機(jī)，日夜驚恐。

不過，恐懼也沒有用，落魄的鳳凰不如雞，這時(shí)候的司馬氏早就是昨日黃花，任人宰割了，為了換取好處，褚秀之、褚淡之知道劉裕的目的，于是投其所好，在奉命看望司馬德文的時(shí)候，劉裕派親兵乘機(jī)殺死他。

至此，晉朝嫡系徹底斷絕，因?yàn)樗抉R德文和前任司馬德宗一樣都沒有子嗣，這就最大成都的保護(hù)了劉裕的安全。

很多人說，劉裕殺光了司馬氏，他把司馬懿的后人都滅族，其實(shí)當(dāng)時(shí)并沒有，司馬氏已經(jīng)開枝散葉很多地方，亂殺偏遠(yuǎn)的宗室沒有任何好處，而且也沒辦法殺光的。他只是誅殺了晉孝武帝之后的兩位皇帝，分別是晉安帝和晉恭帝。

弒殺晉安帝是在419年，當(dāng)時(shí)劉裕聽到一個(gè)讖語說：“昌明之后有二帝”，昌明是孝武帝的名字，為了符合讖語，所以派遣親信王韶之毒殺晉安帝，這位王韶之是王羲之的孫子。隨后迎司馬德文為皇帝。