蚊香是有一定毒性的，所以建議使用的時候不要長時間呆在屋里，用完之后可以給門窗通風，這樣可以減少蚊香對身體帶來的危害。

大多數蚊香的成分中都含有少量殺蟲農藥，包括有機磷類、氨基甲酸酯類，其中有機磷類毒性最大，菊酯類毒性最弱。

現在大多數蚊香有效成分都是菊酯類殺蟲劑，這是一種被國家允許的低毒高校殺蟲劑，在蚊香中也有規定的使用比例。

傳統蚊香中還含有一些細微顆粒物，多環芳香烴、羰基化合物和苯，雖然可能會對人體產生危害，但是蚊香中夾在的含量往往比較小，只要是合理使用就是沒有害處的。

蚊香中的煙霧可能會導致過敏反應，從而誘發哮喘，所以有這類病癥的人應該謹慎使用。

在密閉的房間中使用蚊香切勿單獨呆著，否則可能會引起頭暈、惡心等癥狀。

如今，隨著社會的發展，市面上還出現了電蚊香液，這類產品一次使用最好不要超過八個小時，在使用之前，要檢查蚊香液與電熱加熱器連接是否密閉，防止泄露引發危險。