只要合理科學的使用六偏磷酸鈉，正常人接觸后不會有什么影響，對身體沒有害處，但如果六偏磷酸鈉的含量比較多，可能會引起慢性中毒和氟骨癥，使骨骼中的鈣質減少，導致骨質硬化和骨質疏松。

六偏磷酸鈉中含有一定的氟化物，這種物質會影響人體的健康，尤其是長時間接觸后，會產生中毒現象，或者產生其他不利反應。一般來說，合理使用六偏磷酸鈉，人體不會出現什么問題，但如果大量的使用六偏磷酸鈉，就會對人體健康產生威脅。

現在很多食品中都添加了六偏磷酸鈉，不過都是按照國家標準生產的，但并非所有的廠家都按照標準生產，有些不良廠家會使用大量的六偏磷酸鈉，所有在購買食品前，首先觀察下食品的成分，避免購買含有過量的六偏磷酸鈉食品。

一般來說，六偏磷酸鈉主要用在肉制品、魚肉腸、火腿等食品中，這是為了提高持水性，防止脂肪氧化，另外還會用到豆醬和醬油中，防止變色，增加粘稠性。