綠豆紅豆薏米粥會讓身體冷虛，所以虛寒體質的人不適合長期食用綠豆紅豆粥，懷孕的婦女還有正值經期的女性也不要喝綠豆紅豆薏米粥。

綠豆紅豆薏米粥中有薏米，這種食物中的黏性比較高，所以吃太多的綠豆紅豆薏米粥可能會妨礙消化。

綠豆紅豆薏米粥雖然有降低血脂和血糖的作用，但是這畢竟只是一種保健食材，是不能當作藥物的。

綠豆紅豆薏米粥中的綠豆不建議用鐵鍋煮，因為綠豆中含有單寧，這種成分在高溫條件下遇到鐵會生成黑色的單寧鐵，喝了之后對人體有很大的傷害。

綠豆紅豆薏米粥中在服藥的時候是不可以食用的，這樣可能會降低藥效，對身體不是很友好。

綠豆紅豆薏米粥中的綠豆不適合煮太爛，這樣可能會導致有機酸和維生素遭到了破壞，降低清熱解毒的功效。

綠豆紅豆薏米粥不能和大米一起煮，大米是生長在水里的植物，本身帶有一定的濕氣，如果將大米和綠豆紅豆薏米粥一起煮，會讓粥變黏，甚至破壞紅豆薏米粥利尿去濕的效果。