84消毒液是能夠殺死部分真菌的，但是殺菌效果并不顯著，需要高濃度的比例和長時間的浸泡，84消毒液對于殺死細菌的效果相對比較好。

真菌在自然界中的分布極廣，有十萬多種，其中能引起人或動物感染的僅占極少部分，約300種，很多真菌對人類是有益的，如面粉發酵，做醬油、醋、酒，有的還可以用于生產抗生素和維生素以及酶類，但是部分真菌還會引起動、植物和人類的多種疾病，比如真菌感染，變態反應性疾病，中毒性疾病等等，常見的有腳氣。

84消毒液對于殺死細菌的效果要比真菌要好，盡管細菌和真菌的名稱中都有一個菌字，但細菌的名稱中一般含有：球、桿、弧、螺旋等描述細菌形態的字眼，只有乳酸菌例外，而真菌名稱中則不含有。

如果是得了腳氣，真菌感染的鞋子是可以用84消毒液消毒的，也可以用開水燙洗來消毒，注意帶有腳氣的襪子不要和其他衣物接觸，要注意局部衛生，以防出現交叉感染。

另外，據說用濃度為1.5%的二氯異氰尿酸鈉，即優氯凈，浸泡15—60分鐘也有消除真菌的效果，還有過氧乙酸，即濃度為0.1-0.5%的醋酸也可以殺滅真菌。