先將整個干墨魚泡到清水中，大約需要泡10個小時，中途換幾次清水，直到墨魚變軟。如果著急食用，可以用溫水浸泡，再加入點堿，能縮短浸泡時間。干墨魚泡軟之后，將表皮剝去，再把墨魚的骨板取出。清理殘留的內臟和雜質，最后用清水洗干凈。

干墨魚需要用清水浸泡后才能處理干凈。食用干墨魚時，要選擇顏色和氣味都沒有異常的，如果有特殊的氣味，或者顏色看起來不新鮮，那么這種干墨魚不能吃。如果感覺用冷水浸泡時間比較長，可以準備一盆熱水，放入小蘇打粉，浸泡2、3個小時。

浸泡好的干墨魚，取出來后要將墨魚頭撕下來，還有骨頭也去掉。墨魚處理好后，用干凈的水沖洗，或者用淘米水清洗，之后放在砧板上，根據自己的喜好切成其它形狀即可制作菜肴。

清洗墨魚時，一定要將墨魚表面一層薄膜剝離掉，然后再去除骨頭和內臟，這樣做出來的墨魚不會有腥味，味道很純。挑選干墨魚，要用手捏一下墨魚的肉質是否干燥，好的墨魚聞起來有股海腥味，但不能有腥臭味。